Las funciones de la División de Presupuesto se cumplen de acuerdo con las normas y reglamentos de la Contraloría General de la República y de la Dirección General de Presupuesto. Comprende las siguientes dependencias
Sección de Ejecución y Control - Grupo de Contabilidad
Sección de Sistematización de Datos - Grupo de Análisis y programación - Grupo de Producción - Grupo de Control
Sección de Control y Pagadurías y Bienes - Grupo de Visitadores - Grupo de Central Contable - Grupo de Inventarios