La Dirección General tiene un Director y un Subdirector nombrados por la Junta.
La Dirección General tiene como organismos asesores el Consejo Asesor y el Consejo Médico.
Para les asuntos relacionados con sanidad militar contará con la asesoría de las Jefaturas de Sanidad de Fuerza,
El Director o en su defecto el Subdirector será siempre un Oficial superior de Sanidad, Médico en servicio activo.